Britų pakistaniečių genetinė istorija žemėlapiuose pirmą kartą


Pasak mokslininkų, nauja Britanijos Pakistano populiacijos genetinės įvairovės analizė turės svarbių pasekmių medicinos tyrimams.

Tyrimas – pirmasis tokio pobūdžio – atskleidžia, kad šios populiacijos genetinę struktūrą maždaug 2000 metų suformavo socialinė biraderi sistema – santuokos tarp klanų praktika.

Paskelbta m Gamtos komunikacijostyrimą atliko Lidso universitetas, Sveiki atvykę į Sangerio institutą, Bradfordo sveikatos tyrimų institutas (BIHR) ir jų bendradarbiai.

Tiksli analizė detalizuoja genetinius skirtumus tarp biraderi grupių, kurios turės svarbių pasekmių rengiant medicininius tyrimus, kuriais siekiama atrasti įprastų ligų, tokių kaip diabetas ir širdies ligos, genetines šaknis.

Duomenys padės užtikrinti, kad Pakistano protėviai būtų įtraukti į tokius tyrimus ir galės pasinaudoti naujomis žiniomis bei terapijos metodais.

Dr Markas Ilesas iš Lidso Medicinos mokykla ir Lidso duomenų analizės institutasyra vyresnysis tyrimo autorius.

Jis sakė: „Tyrimas yra žingsnis į priekį siekiant galimos genetinių tyrimų naudos marginalizuotoms populiacijoms, atitinkantis norą išplėsti genetinių tyrimų žinių bazę ir klinikinę naudą.

Genetiniai variantai

Žmogaus genomai – visas genetinės informacijos rinkinys – yra maždaug 99,9% identiški kiekviename žmoguje, neatsižvelgiant į kilmę.

Likę 0,1% turi skirtumų tarp individų, vadinamų genetiniais variantais, kurie daro mus unikalius.

Dauguma iki šiol atliktų genetinių tyrimų buvo atlikti su Europos protėvių individais, o tai leido geriau suprasti žmogaus genetinę variaciją, populiacijos struktūrą ir genetinės variacijos vaidmenį sergant ligomis.

Tačiau išvados apie genetinį poveikį europiečių ligoms gali būti netinkamos kitų etninių grupių asmenims.

Pastaraisiais metais ne europiečių tyrimai pradėjo pateikti išsamesnį žmogaus genetinės įvairovės ir susijusių medicininių pasekmių vaizdą.

Istorija ir kultūra turėjo įtakos įvairių pasaulio šalių populiacijų genetinei struktūrai. Vienas iš tokių kultūrinių veiksnių yra biraderi socialinė sistema, kuri šimtmečius buvo praktikuojama Pakistano populiacijose.

Istoriškai žmonės buvo linkę tuoktis savo biraderi (bendruomenės) viduje, kad sustiprintų paveldimą socialinį statusą, profesiją ir žemės nuosavybę.

Ši sistema tam tikru mastu vis dar taikoma ir Pakistane, ir Pakistano protėvių populiacijose tokiose šalyse kaip JK.

Genomų analizė

Šiame tyrime mokslininkai išanalizavo daugiau nei 4000 Pakistano protėvių genomus kartu su pačių pateikta informacija apie jų šeimos istoriją*, kad ištirtų Britanijos Pakistano populiacijos genetines savybes.

Šiuos duomenis rinko Bradfordo sveikatos tyrimų institutas (BIHR) kaip dalis Gimė Bradforde projektas**.

Lidso ir Wellcome Sanger instituto mokslininkai išanalizavo genominius duomenis, kad nustatytų smulkios populiacijos struktūrą ir ištirtų britų pakistaniečių demografinę istoriją.

Nors buvo nustatyta, kad Bradfordo pakistaniečių grupės yra genetiškai panašios į kitas Pakistano ir Indijos populiacijas, tyrimas parodė, kad biraderi socialinė sistema vaidino svarbų vaidmenį formuojant genetinę variaciją.

Dalyviai dalijosi ta pačia genetine istorija iki maždaug 2000 metų, kai jie pradėjo skirstytis į biraderi grupes, įskaitant Pathan, Jatt, Rajput, Awan, Gujjar, Mughal, Syed, Arain, Qasabi ir Bains.

Sangerio daktarė Elena Arciero atliko analizę, kuri atskleidė, kad kai kurios grupės patyrė efektyvaus populiacijos skaičiaus sumažėjimą įvairiais istorijos momentais***. Taip galėjo nutikti dėl santuokų skaičiaus padidėjimo grupėse arba faktinio gyventojų skaičiaus sumažėjimo, kaip užfiksuota surašymo duomenimis.

Socialinė istorija

Dr. Sufyan Dogra, vyresnysis mokslinis bendradarbis iš Bradfordo sveikatos tyrimų instituto (BIHR), sakė: „Prieš šį tyrimą mūsų žinios apie šių biraderių genetinę istoriją buvo gana menkos, todėl tai labai prisideda prie mūsų socialinės istorijos supratimo. Pakistano.

„Yra istorinių įrodymų, kad santuokos tarp biraderių grupių pradėjo daugėti maždaug prieš 2000 metų ir tapo griežtesnės kolonijiniais laikais, valdant Britanijos Rajui, kai buvo įvesti nauji nekilnojamojo turto mokesčiai, siekiant gauti pajamų.

„Tai gali paaiškinti efektyvaus populiacijos dydžio sumažėjimą, kurį stebime genominiuose duomenyse.

Ankstesni Born in Bradford tyrimai parodė, kad pirmųjų pusbrolių vaikams padidėja recesyvinių sutrikimų rizika, panašiai kaip vaikams, gimusiems 34 metų ir vyresnėms britų motinoms****.

Šiame tyrime nustatyta, kad recesyviniai sutrikimai dažniau pasitaiko tarp porų, kurios nėra glaudžiai susijusios, bet yra iš tos pačios biraderių grupės, vaikai, nes jų tėvai yra toli giminingi.

Tačiau pirmųjų pusbrolių vaikams rizika yra bent dešimt kartų didesnė nei nesusijusių tėvų vaikams iš to paties biraderio.

Medicininės pasekmės

Išvados turi svarbių medicininių pasekmių britų pakistaniečiams. Įprastų ligų, tokių kaip 2 tipo diabetas ir širdies ligos, paplitimas yra nuo dviejų iki keturių kartų didesnis nei baltųjų Didžiosios Britanijos gyventojų.

Išsami tyrime suplanuota genetinė struktūra padės mokslininkams planuoti būsimus tyrimus ir ieškoti bendrų variantų, susijusių su šiomis ir kitomis sveikatos problemomis, siekiant pagerinti šių ligų diagnostiką ir gydymą bei pritaikyti profilaktikos patarimus.

Dr Hilary Martin, vyresnioji tyrimo autorė iš Wellcome Sanger instituto, sakė: „Planuojant medicininius tyrimus, pvz., genomo masto asociacijos tyrimus, svarbu suprasti tikslią populiacijos struktūrą.

„Tikiuosi, kad mūsų išvados bus pagrindas būsimiems Pakistano populiacijų genetinių ligų priežasčių tyrimams“.

Tolimesnė informacija

* Dalyvių buvo paprašyta pranešti apie savo biraderi grupę, ar jų tėvai buvo susiję, ir vietą, iš kurios jie ar jų tėvai kilę iš Pakistano.

** Šiuos duomenis surinko Bradfordo universiteto, Lidso universiteto ir Bradfordo sveikatos tyrimų instituto (BIHR) mokslininkai. Gimė Bradforde tyrimas, kurio metu tiriamos aplinkos, socialinės ir genetinės prastos sveikatos ir gyvenimo rezultatų priežastys viename labiausiai nepasiturinčių JK miestų, naudojant daugiau nei 10 000 šeimų duomenis. Profesorius Neilas Smallas, šio tyrimo autorius iš Bradfordo universiteto, sakė: „Tyrimas „Born in Bradford“ vykdomas nuo 2007 m. ir labai prisidėjo prie būdų, kaip mieste galima pagerinti sveikatą ir gerovę. „Born in Bradford“ komanda klausia tyrimo dalyvių patarimų ir dalijasi išvadomis leidiniuose bei susitikimuose, kuriuos gali pasiekti vietos žmonės. Šiame tyrime patarimai buvo gauti iš Bradfordo Pakistano bendruomenės narių, kurie buvo pripažinti kaip ypač suinteresuoti ir išmanantys, kaip ši bendruomenė yra organizuojama.

***Efektyvus gyventojų skaičius atspindi vaikų turinčių žmonių dalį ir jų santuokos modelius, o ne tikrąjį (surašymo) gyventojų skaičių. Pavyzdžiui, jei šalies gyventojų skaičius yra vienas milijonas žmonių, bet ištisas kartas kiekvienas pasirenka savo partnerį iš 500 asmenų, gyvenančių savo kaime, efektyvus gyventojų skaičius bus daug mažesnis nei vienas milijonas.

****Recesyviniai sutrikimai yra tie, kai vaikas turi paveldėti tam tikrą DNR variantą iš abiejų tėvų, kad jį paveiktų. Ankstesni tyrimai parodė didesnį rizikos lygį santuokose, kuriose tėvai buvo giminingi. Daugiau informacijos apie lyginamąją riziką.

Smulki britų pakistaniečių gyventojų struktūra ir demografinė istorija“, Elena Arciero ir kt. (2021), paskelbta Gamtos komunikacijos.

DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-021-27394-2

Finansavimas: šį darbą parėmė Wellcome.

Norėdami gauti daugiau informacijos, susisiekite su Ianu Rosseriu, Lydso universiteto ryšių su žiniasklaida, adresu [email protected]